23 января 2014 года Кокшетауский медицинский колледж успешно прошел предварительный аудит в рамках институциональной аккредитации, согласно договора № 120 по «Проведению институциональной аккредитации» от 22 мая 2013 г. между независимым казахстанским агенством по обеспечению качества в образовании и КМК. На данный момент завершен І этап прохождения процедуры институциональной аккредитации, а также специализированной аккредитации по следующим образовательным программам: 0301000 «Лечебное дело», 0302000 «Сестринское дело», 0304000 «Стоматология».